Pour Linux ça ne pose aucun problème, ton 2eme HDD devrait s'apeller /dev/hdb comme d'hab.
Il faut juste savoir si ta Xbox voudra bien démarrer dans cet état, avec un Cromwell ça marche au top, j'avais essayé il y a assez longtemps avec un BIOS X2, ça mettait plus de temps que d'ordinaire au démarrage mais ça marchait bien.