tu ne pourras pas créer un partition virtuelle de 50Go sur un système de fichier FatX facilement, la limite des fichiers y est de 4Go! Il existe néanmoins un moyen de chainer plusieurs fichiers de ce genre pour faire une grosse partition virtuelle, je sais plus avec quoi on fait ça (vlc?). Dans ce cas tu peux faire l'install comme tu veux sur E, et créer sur F des fichiers: homefs01, homefs02, ..., homefs23 que tu chaineras pour en faire un seul et unique système de fichier.
Je crois que quelqu'un parle de ça dans le wiki de http://xbox-linux.org .
Mais il me semble clair que les performances seront moins bonnes que si tu formates ta partition F en ext3 ou reiserfs.