J'ai eu exactement le même problème. En surveillant les voyants de ma box j'ai vu que le téléchargement s'arrêtait au second IOS.
Par contre au redémarrage il reprend bien à l'IOS suivant... Du coup en relançant le programme plusieurs fois ca a marché.
De plus je n'ai pas fait la dernière étape du tuto : après cela j'ai pu installer la chaine homebrew sur ma Wii en 4.0E
(du coup je ne vois plus l'intérêt du downgrade complet)
bye