Après de nombreux essais et recherches d'aides, je suis enfin venu à bout de DSFTP !
Une personne d'un autre forum m'a raconté qu'il avait le même soucis que moi, mais que ça fonctionnait lorsqu'il jouait à Tetris online puis qu'il faisait un soft reset pour lancer DSFTP. C'est ce que j'ai fait, et maintenant ça semble fonctionner.
Donc pour résumer ce que j'ai fait: Lancer un rom de Tetris, paramètrage Wifi, test de connexion ensuite j'ai fait un soft reset (A+B+X+Y+L+R quand le soft reset est activé (petite del verte à droite dans le browser de fichier du M3)), puis lancé DSFTP et hoplà.
EDIT: Après un démarrage à 40ko/s, au bout d'une minute la connexion tape une pointe à 150ko/s avant de se stabiliser à 85 ko/s. C'est pas ma finalement, mieux que ce à quoi je m'attendais. En revanche, à peine 30ko/s en upload (PC vers DS), malheureusement c'est le plus utile...